- Pangdam VI/Tanjung Pura (1997—1998)
- Danjen Kopassus (1998—1999)
- Karier Militer Terhenti Diduga karena Kasus Munir
Baca Juga: Curiga Ada 'Main Mata', Rekonstruksi Hanya Tonjolkan Adegan Putri Candrawathi di Ranjang
Diketahui, Muchdi Purwoprandjono pernah menggantikan posisi Prabowo Subianto yang diberhentikan sebagai Danjen Kopassus akibat skandal dugaan upaya kudeta Presiden BJ Habibi kala itu.
Namun, karirnya berjalan singkat karena nama sang Jenderal terseret dalam kasus penculikan 13 aktivis mahasiswa pada era demonstrasi refirmasi 1997 hingga 1998.
Karena itu, Mayjen TNI Muchdi Purwoprandjono diberhentikan dan dimutasi ke Perwira Tinggi (Pati) Mabes TNI pada 1999 hingga 2001.
Kemudian pada pemerintahan Megawati Soekarnoputri, Muchdi Purwoprandjono diangkat menjadi Deputi V Badan Intelijen Negara (BIN) mendampingin A.M Hendropriyono yang baru saja dilantik di Kabinet Gotong Royong bentukan Megawati.
Baca Juga: Evolusi Kijang Innova 2023 'Ga Ngotak', MPV Andalan Toyota Generasi Ketiga, Desainnya Gokil!
Mayjen TNI Muchdi Purwoprandjono menjadi Deputi BIN V selama 4 tahun dari 2001 hingga 2005. Saat ini dia tengah menjadi ketua Partai Berkarya bentukan Tommy Soeharto.***